Bir köy başkanının oğlu ve milliyetçi önder Barthelemy Bogonda`nın yeğeniydi.1939`da Fransız ordusuna girmeden önce yerel misyoner okullarında eğitim gördü.Fransızların Çinhindi`nde giriştikleri çatışmalarda üstün başarı göstererek Lí©gion d`honneur ve Croix de Guerre nişanlarıyla ödüllendirildi.1961`de yüzbaşı oldu.
Başkan David Dacko`nun isteği üzerine, bağımsızlığına yeni kavuşan Orta Afrika Cumhuriyeti`nin ordusuna komuta etmek için Fransız kuvvetlerinden ayrıldı.Ama yüksek askeri konumunu 1966`da Dacko`yu devirmek için kullandı ve kendini cumhurbaşkanı ilan etti.Görevi sırasında iç ve dış politikasının baskıcı ve bir günü öbürüne uymayan niteliğiyle tanındı.Yönetimi boyunca hükümet görevlileri sürekli değiştirildi ve başkanın yetkileri gittikçe artırıldı.
1977`de Bokassa, hayran olduğu Napolyon`u taklit ederek I. Bokassa adıyla taç giydi ve cumhuriyetin adını Orta Afrika İmparatorluğu olarak değiştirdi.Ama, kısa süren saltanatı Fransa`nın da desteklediği askeri bir darbeyle sona erdi.Darbeden sonra cumhuriyet yeniden kuruldu ve Eylül 1979`da Dacko yeniden başkanlığa getirildi.Bokassa ise Fildişi Kıyısı`na sürgüne gitti.
Bokassa, yönetimi boyunca Fransa`yla çoğunlukla iyi ilişikiler kurduysa da, sürgündeyken düş kırıklığına uğradı.1980`de bir Fransız gazetesine, Fransa cumhurbaşkanı Valí©ry Giscard d`Estaing`e armağan ettiği elmaslar konusunda açıklamada bulunması, Fransa ile Fildişi Kıyısı arasındaki ilişkileri gerginleştirdi.Bu durumun Giscard`ın sonraki seçimlerde uğradığı yenilgiyi de etkilediği sanılmaktadır.
Sonradan Fransa`ya giden Bokassa, ülkesinde, gıyabında yargılanarak ölüm cezasına çarptırıldı. Eylül 1986`da ülkesine döndüğünde tutuklandı ve işkence, adam öldürmek, yamyamlık, zimmetine para geçirmeyi de içeren çeşitli suçlardan yeniden yargılandı. Haziran 1987`de, yeterli kanıt bulunamadığı için yamyamlık suçlamasından aklandı, ama işkenceyle adam öldürmek ve zimmetine para geçirmek suçlarından ikinci kez ölüm cezasına çarptırıldı. Avukatlarının Yüksek Mahkeme`ye başvurması üzerine cezası 1988`de ömür boyu hücre hapsine çevrildi. Ağustos 1993`te çıkarılan çıkarılan genel afla serbest bırakıldı, 1996`da kalp krizi geçirerek öldü. Bokassa`nın 17 karısı ve 50 çocuğu vardı.