Karamenderes Nehri, eski adı Skamander olan, Kaz Dağı'ndan doğan, tamamı Çanakkale ili sınırları içerisinde akan ve Çanakkale Boğazı ile Ege Denizi'nin kesiştiği bölge olan Truva Tarihî Millî Parkı yakınlarında denize dökülen nehir.
Homeros'un destanı İlyada'ya göre nehrin aşağı kısımlarında yer alan Troya'da Truva Savaşı'nın bir bölümü yaşanmıştır.
Adını Yunanca kökenli "menderes" sözcüğünden alan Karamenderes havzasının sınırları, denize döküldüğü Çanakkale ilinin merkez ilçesi ile Ezine, Ayvacık ve Bayramiç ilçelerine dek uzanmaktadır. Karamenderes havzasının %39,8'lik bir bölümünde tarım yapılmaktadır.
Tarım arazilerinin yanında 96 kuş türünü de barındıran havzada bulunan taş ocakları, çevre ve tarihî dokuyu tehdit etmektedir.