Pelister, Mavrovo ve Galiçya dağları aynı zamanda milli park niteliği taşır.
Makedonya Cumhuriyeti`nin en önemli dağları şunlardır:
- Korab Dağı (2764 m)
- Şar Dağı (2747 m)
- Baba Dağı(2601 m)
- Jakupica (2540 m)
- Nidze (2521 m)
- Deshat (2373 m)
- Galichica (2288 m)
- Stogovo (2273 m)
- Jablanica (2257 m)
- Deshat (2375 m)
- Osogovo (2252 m)
- Kožuf (2166 m)
- Bistra (2163 m)
- Celoica (2062 m)
- Belasica (2029 m)