Moritz Balthasar Borkhausen (3 Aralık 1760, Giessen - 30 Kasım 1806, Darmstadt), Alman doğa bilimci. Bitki bilim mahlası Borkh.'dir.
Eğitimini Giessen'de aldı ve 1796'da Darmstadt'taki ormancılık ofisinde çalışmaya başladı. 1800'de Kammerrat unvanını aldı ve ardından 1804'te Oberforsthaus Collegium'da danışman olarak görev yaptı.
Bir bitki bilimci olarak, Alliaceae ve Asclepiadaceae taksonlarını literatüre dahil etmenin yanı sıra çok sayıda bitki cinsi ve türünün tanımladı.