01 Ocak 1962 tarihinde Kayseri'de doğdu. Erciyes Üniversitesi Mühendislik Fakültesi, Elektronik Mühendisliği Bölümünden mezun olan Alkan, Niğde Üniversitesi Elektronik Bölüm Başkanlığı yaptı. Yüksel lisans ve doktora eğitimini Erciyes Üniversitesi Mühendislik Fakültesi, Elektronik Mühendisliği Bölümü Elektronik Ana Bilim Dalında yaptı.
Elektronik İmza Koordinasyon Kurulu Başkanı olan Mustafa Alkan ingilizce bilmektedir. e-imza
Alkan, evli ve 2 çocuk babasıdır.