Salih Zeki'nin, matematik ve astronomi bilimlerinde kullanılan bütün terimleri açıklamak ve Doğulu ve Batılı bütün matematikçilerle astronomların hayat öykülerini ve eserlerini tanıtmak maksadıyla yayımlamaya başladığı Kamus-ı Riyaziyyat (Matematiksel Bilimler Sözlüğü, Cilt 1, 1892) adlı eseri de Türk bilim tarihi açısından çok değerlidir. Çünkü hem matematik ve astronomi terimlerinin hem de matematik ve astronomi tarihi terimlerinin tanımlarını ve açıklamalarını içermektedir. Yayımının tamamlanmamış olması, Türk kültür tarihi açısından çok büyük bir kayıp olmuştur.
Salih Zeki, bilim tarihinin yanında bilim felsefesi ile de ilgilemiş ve ünlü Fransız matematikçisi ve felsefecisi Henri Poincaré'nin (1854-1912) bilim felesefesi ile ilgili Bilimin Değeri, Bilim ve Yöntem, Bilim ve Varsayım ve Son Düşünceler adlı eserleri ile Alexis Bertrand'ın Bilimsel Felsefe adlı eserlerini Türkçe'ye çevirerek, bilim felsefesinin Türkiye'de tanınmasını ve yaygınlaşmasını sağlamıştır.