Hem askeri hem de sivil kullanım için üretimi yapılmıştır. Askeri tipleri hem yüzey gemileri hem denizaltı gibi çalışabilmektedir. Sivil amaçlı veya çatışma için kullanılmayan askeri cep denizaltıları suya dalarlarken yüzey gemileri ile birlikte çalışırlar.
Askeri kullanım — II. Dünya Savaşı
Japonya
Beş ``Ko-hyoteki`` sınıfı cep denizaltısı 1941 yılında Tip 97 Torpidoların kullanıldığı Pearl Harbor saldırısına katıldı. Bir tanesi limana girerken USS Ward tarafından vurularak batırıldı. Bu denizaltı NOAA Hawaii Denizaltı Araştırma Laborratuvarı (HURL) tarafından Ağustos 2002 tarihinde tesbit edildi.Birleşik Devletler Donanma Enstitüsü`nün 1999`da yaptığı analizlerden cep denizaltısının ``USS West Virginia`` `ya tam isabet kaydetmiş olabileceği açıklanmıştır. Bazı tarihçiler ise bunun mümkün olamayacağını söyler: Sadece bir denizaltı limana girebilmiş ve torpidolarını USS Curtiss ve USS Monaghan`a fırlatabilmiştir, Diğer denizaltı USS St. Louis`e limanı terkederken saldırmıştır, Diğer üç denizaltı (bir tanesi ele geçirilmiş, biri 1960 yılında bulunmuş diğeri 2003 yılında bulunmuştur) bulundukları zaman her iki torpidoları ile birliktedir. Bu durum fotoğraf yorumunun şüpheli olduğunu düşündürmektedir.