TürkçeBilgi

Transkripsiyon Faktör Sınıfları Listesi

Kısaca: Transkripsiyon faktörleri çoğu zaman DNA bağlanma bölgelerindeki benzerliğe göre sınıflandırılırlar: ...devamı ☟

Transkripsiyon faktör sınıfları listesi — Transkripsiyon Faktör Sınıfları Listesi

Transkripsiyon faktörleri çoğu zaman DNA bağlanma bölgelerindeki benzerliğe göre sınıflandırılırlar:cite journal | author = Stegmaier P, Kel AE, Wingender E | title = Systematic DNA-binding domain Classification of transcription factors | journal = Genome informatics. International Conference on Genome Informatics | volume = 15 | issue = 2 | pages = 276-86 | year = 2004 | pmid = 15706513 | doi = | issn = | url = http://www.jsbi.org/journal/GIW04/GIW04F028.html cite journal | author = Matys V, Kel-Margoulis OV, Fricke E, Liebich I, Land S, Barre-Dirrie A, Reuter I, Chekmenev D, Krull M, Hornischer K, Voss N, Stegmaier P, Lewicki-Potapov B, Saxel H, Kel AE, Wingender E | title = TRANSFAC^Â® and its module TRANSCompel:^Â® transcriptional gene regulation in eukaryotes | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 34 | issue = Database issue | pages = D108-10 | year = 2006 | pmid = 16381825 | doi = 10.1093/nar/gkj143 | issn = cite web|başlık=TRANSFAC^Â® database|url=http://www.gene-regulation.com/pub/databases/transfac/cl.html|erişimtarihi = 2008-01-10

1 Üst sınıf: Bazik bölgeler (Bazik-sarmal-halka-sarmal)

" target="_blank"> kalıntıları bir fermuarın dişleri gibi birbirlerine geçerler.]

1.1 Sınıf: Lösin fermuar faktörleri (bZIP)

1.1.1 Aile: AP-1(-türü) bileşkeler; (c-Fos/c-Jun) dahildir
1.1.2 Aile: CREB
1.1.3 Aile: C/EBP-türü faktörler
1.1.4 Aile: bZIP / PAR
1.1.5 Aile: Bitki G-kutusuna bağlanan faktörler
1.1.6 Aile: sade ZIP

1.2 Sınıf: sarmal-halka-sarmal faktörler (bHLH)

1.2.1 Aile: Her yerde bulunan (``Ubiquitous``) (Sınıf A) faktörler
1.2.2 Aile: Myojenik transkipsiyon faktörleri (MyoD)
1.2.3 Aile: Achaete-Scute
1.2.4 Aile: Tal/Twist/Atonal/Hen

1.3 Sınıf: sarmal-halka-sarmal / Lösin fermuar faktörler (bHLH-ZIP)

1.3.1 Aile: Her yerde bulunan bHLH-ZIP faktörleri; USF (USF1, USF2); SREBP) dahildir
1.3.2 Aile: Hücre döngüsü kontrol faktörleri; c-Myc dahildir

1.4 Sınıf: NF-1

1.4.1 Aile: NF-1 (NFIC)

1.5 Sınıf: RF-X

1.5.1 Aile: RF-X (NFX2, NFX3, NFX5)

1.6 Sınıf: bHSH

2 Üst sınıf: Çinko koordinasyonu yapan DNA bağlanma bölgeleri

2.1 Sınıf: Cys4 Çekirdek reseptörlerinin çinko parmağı tipi

2.1.1 Aile: Steroit hormon receptörleri
2.1.2 Aile: Tiroit hormon reseptörü-gibi faktörler

2.2 Sınıf: dçeşitli Cys4 çinko parmakları

2.2.1 Aile: GATA transkripsiyon faktörleri

2.3 Sınıf: Cys2His2 çinko parmağı bölgesi

2.3.1 Aile: Her yerde bulunan faktörler, TFIIIA, Sp1 dahil
2.3.2 Aile: DGelişimsel / hücre döngüsü düzenleyicileri; Krüppel dahildir
2.3.4 Aile: NF-6B-gibi bağlanma özelliği olan büyük faktörler

2.4 Sınıf: Cys6 sistein-çinko öbekli
2.5 Sınıf: Dönüşümlü içerikli çinko parmaklar

3 Üst sınıf: sarmal-halka-sarmal

3.1 Sınıf: Homeo bölgesi

3.1.1 Aile: Sadece Homeo bölgesi; Ubx dahildir
3.1.2 Aile: POU bölgesi faktörleri; Oktamer transkripsiyon faktörü (Oct) dahildir
3.1.3 Aile: LIM bölgeli Homeo bölgesi
3.1.4 Aile: Homeo bölgesi ile çinko parmak motifleri

3.2 Sınıf: Eşli kutu (``paired box``)

3.2.1 Aile: Eşli ile homeo bölgesi
3.2.2 Aile: Yalnızca Eşli bölge

3.3 Sınıf: Fork head / winged helix

3.3.1 Aile: Gelişimsel düzenleyiciler; forkhead dahildir
3.3.2 Aile: Doku-spesifik düzenleyiciler
3.3.3 Aile: Hücre döngüsü kontrol faktörleri
3.3.0 Aile: diğer düzenleyiciler

3.4 Sınıf: Isı şoku faktörleri

3.4.1 Aile: HSF

3.5 Sınıf: Tryptofan öbekleri

3.5.1 Aile: Myb
3.5.2 Aile: Ets-benzeri
3.5.3 Aile: Interferon düzenleyici faktörler

3.6 Sınıf: TEA bölgesi

3.6.1 Aile: TEA (TEAD1, TEAD2, TEAD3, TEAD4)

4 Üst sınıf: küçük oluk temaslı beta-iskele faktörleri

4.1 Sınıf: RHR (Rel homoloji bölgesi)

4.1.1 Aile: Rel/ankyrin; NF-kB
4.1.2 Aile: yalnızca ankyrin
4.1.3 Aile: NF-AT (NFATC1,NFATC2)

4.2 Sınıf: STAT

4.2.1 Aile: STAT

4.3 Sınıf: p53

4.3.1 Aile: p53

4.4 Sınıf: MADS-kutusu

4.4.1 Aile: Gelişim düzenleyicileri; (Mef2) dahildir

4.4.2 Aile: Dış sinyal tepki verenler, SRF (serum tepki faktörü)

4.5 Sınıf: beta-fıçı alpha-sarmal transkripsiyon faktörleri
4.6 Sınıf: TATA bağlanma proteinleri

4.6.1 Aile: TBP
4.7.1 Aile: SOX, SRY
4.7.2 Aile: TCF-1
4.7.3 Aile: HMG2-benzeri, SSRP1
4.7.5 Aile: MATA

4.8 Sınıf: Heteromerik CCAAT faktörler

4.8.1 Aile: Heteromeric CCAAT faktörleri

4.9 Sınıf: Grainyhead

4.9.1 Aile: Grainyhead

4.10 Sınıf: Soğuk şoku bölgesi faktörleri

4.10.1 Aile: csd

4.11 Sınıf: Runt

4.11.1 Aile: Runt

0 Üst sınıf: Diğer transcription Faktörleri

0.1 Sınıf: Bakır yumruk proteinleri
0.2 Sınıf: HMGI(Y)

0.2.1 Aile: HMGI(Y)

0.3 Sınıf: Cep bölgesi
0.4 Sınıf: E1A-benzeri faktörler
0.5 Sınıf: AP-2/EREBP-ilişkili faktörler

Kaynakça

Reflist|2

Kaynaklar

Vikipedi

İlgili konular

dna digital object identifier lösin p53 transkripsiyon faktörü pou bölgesi ubx oktamer transkripsiyon faktörü fox proteins winged-helix transcription factors

Bu konuda henüz görüş yok.

Transkripsiyon faktör sınıfları listesi Resimleri

Transkripsiyon

üzerinde belli bir diziye bağlanabilen bir protein. Transkripsiyon faktör sınıfları listesi Transkripsiyon (müzik), notalandırılmamış bir parçanın notalandırılması;...

Transkripsiyon, 1965, AIDS, Adenin, Apoptoz, Arke, DNA çoğalması, E. coli, Faj, Fosfat, Gen

Transkripsiyon faktörü

Moleküler biyolojide bir transkripsiyon faktörü genlerin transkripsiyonunu düzenlemek için DNA üzerinde belli bir diziye bağlanabilen bir proteindir....

Transkripsiyon faktörü, Akış aşağı ve akış yukarı (DNA), Apoptoz, Candida albicans, DNA, Digital object identifier, Diyabet, Fosforilasyon, Gen, Histon, Hücre zarı

SREBP

düzenleme elemanı" adlı DNA dizisine bağlanan transkripsiyon faktörleridir. SREBP'ler transkripsiyon faktörlerinin bazik-sarmal-ilmik-sarmal lösin fermuar (İng...

Mesajcı RNA

Önemli bir fark, transkripsiyon sırasında ökaryotik RNA polimerazın mRNA işlenme enzimleriyle beraber olmasıdır, öyle ki transkripsiyon başladıktan sonra...

Mesajcı RNA, Biyokimya, Taslak

DNA

genlerin transkripsiyonunu etkinleştirir veya engeller. Transkripsiyon faktörleri bunu iki farklı yoldan gerçekleştirir. Birincisi, transkripsiyondan sorumlu...

DNA, Ribozom, TRNA, Amino asit, Timin, Urasil, RNA, MRNA, Protein, DNA'nın çoğalması, Nükleotid, Hücre, Hücre bölünmesi, Ökaryot, Prokaryot

Sinyal transdüksiyonu

ürünleri arasında enzimler ve transkripsiyon faktörleri de bulunur. Sinyal iletim kaskadı sonucu üretilen transkripsiyon faktörleri sonra başka genleri de...

LDL reseptörü

gerektirmektedir. Ligand bağlayıcı bölgenin yanı başında epidermal büyüme faktörü öncülü homoloji bölgesi (ing. epidermal growth factor (EGF) precursor homology...

Metilasyon

artmıştır. Bir hücrenin toplam metilasyon durumu karsinogeneze sürükleyici bir faktör olabilir, çünkü genom çapında metilasyonun kromozom istikrarsızlığı ve artan...