1506 yılında Buhara'yı ele geçirmiş ve 1561'de yönetim merkezini Buhara'ya taşıdığı için Buhara Hanlığı olarak anlımaya başlamıştı. Şeybani ya da Şibanoğulları Hanlığı 1599'da yılında Astrahan Hanlığı kökenli olan Cani bek'in oğulları Din Muhammed, Baki Muhammed ve Vali Muhammed kardeşleri tarafından yıkılmış ve Buhara Hanlığı Aştar Han hanedanı (ya da Cani hanedanı)nın eline geçmişti.
Şeybani hanları
- Ebu'l Hayır (1429-1468)
- Muhammed Şeybani (1500-1510)
- Köçkuncu (1510-1531)
- Müzafferreddin Ebu Said (1531-1534)
- Ebu'l Gazi Ubeydallah (1534-1539)
- I. Abdallah (1539-1540)
- Abdüllatif (1540-1552)
- Nevruz Ahmed (1552-1556)
- I. Pir Muhammed (1556-1561)
- İskender (1561-1583)
- II. Abdallah (1583-1598)
- Abdül Mumin (1598-1598)
- II. Pir Muhammed (1598-1598)